خامنه اي در جريان انتخابات خبرگان, عليرغم پا به گور بودن مشكيني از او خواست كه همچنان در خبرگان حضور يابد (عليرغم عدم تمايل اعلام شده اش به شركت در انتخابات), تا براي مدتي هم كه شده مانع رئيس مجلس شدن رفسنجاني شود.
بدنبال مرگ مشكيني يك جنگ پشت صحنه براي رياست خبرگان در گرفته است. قرار است در نيمه شهريور 86 مجلس خبرگان تشكيل و رياست خبرگان (بجاي مشكيني) را مشخص كنند.
باند آخوند مصباح يزدي, آخوند خزئلي و احمد خاتمي در تلاش براي رياست آخوند مصباح يزدي به رياست مجلس است. اما با توجه به اينكه كانديداهاي طرفدار مصباح يزدي عموما توسط شوراي نگهبان صلاحيت كانديداتوري آنها لغو شده بود و از بقيه هم تعداد كمي به مجلس راه يافتند, در محافل داخلي رژيم شانس آخوند مصباح يزدي رياست اين مجلس بالا نيست.
رفسنجاني در پشت صحنه فعال شده و تلاش ميكند كه طرفدارانش را در پشت خودش يكپارچه نمايد. در همين رابطه در مجلس شوراي اسلامي طرفداران خودش را موفق شده كه يكپارچه كند.
در محافل دروني گفته ميشود كه حملات به رفسنجاني از طرف روزنامه كيهان و باند احمدي نژاد (فاطمه رجبي) را در اين شرايط به انتخاب رياست خبرگان مربوط است.
عليرغم تبليغات عليه رفسنجاني و مطرح شدن آخوند يزدي بعنوان رئيس مجلس, گزارشات داخل رژيم حاكي كه احتمال رئيس مجلس شدن رفسنجاني بالا است
ملاحظه
 انتخابات مجلس چهارم خبرگان در آذرماه 85 انجام شد. و نتايج آن به شرح زير بود:
 رفسنجاني در تهران با 1 ميليون و 560 هزار بيشترين راي را آورد. كه تقريبا دو برابر آخوند مصباح يزدي بود.
 ليست جامعتين (جامعه روحانيت مبارز و جامعه مدرسين) دركل كشور, بيش از 90 درصد آرا مجلس خبرگان را به خود اختصاص دادند. و در اين انتخابات خط حذف رفسنجاني توسط دار و دسته مصباح شكست خورد
 جامعتين كه اكثر مطلق كرسي هاي خبرگان چهارم را دارند, آخوندهاي سنتي طرفدار خامنه اي هستند كه رفسنجاني را نيز به عنوان يك ركن نظام قبول دارند. و خواهان وحدت بين خامنه اي و رفسنجاني هستند
 انتخابات چهارم خبرگان بخاطر مريضي مشكيني كه نميخواست كانديد شود و در آن صورت رفسنجاني احتمال رياست مجلس را داشت. يكي از پر تضادترين انتخابات خبرگان در دوران اين رژيم بود كه بلاخره خامنه اي فشار آخوندهاي بالا رژيم ناچار شد با وارد كردن مشكيني در اين مجلس موضوع رياست رفسنجاني را به تأخير بياندازد. كه حال با مرگ مشكيني مسئله دوباره روي ميز آمده است.